Neben diese wissenschaftpolitische Aufgaben tritt die wissenschaftliche Beschäftigung mit der Geschichte und Theorie der Biologie. Im Rahmen der ersten Jahrestagung in Marburg wurden hierzu die folgenden Leitlinien formuliert:

1. Es soll das Anliegen der Biologiehistoriker in der DGGTB sein, besonders die biologische Tradition des 19. Jahrhunderts, die zu einem beträchtlichen Teil "deutsch geschrieben" ist, zu erschließen und ins historische Bewußtsein zu heben.
2. Aus der Brückenfunktion der biologischen Wissenschaften zwischen den Natur- und Geisteswissenschaften erwächst ein spezifischer interdisziplinärer Auftrag an die Biologiehistoriker und - theoretiker zur Überwindung jener geistigen Spaltung, die ihren Ausdruck im Wort von den "zwei Kulturen" gefunden hat.
3. Die immer noch von den sogenannten "exakten Wissenschaften" dominierte "Philosophy of Science" gilt es durch die Hereinnahme der Biologie auf eine neue Stufe der Reflexion zu heben um damit auf lange Sicht das herrschende Bild der Wissenschaften "umzubauen".
4. Die DGGTB muß anstreben, sich mit dem Stand der Methodenreflexion in der Biologiegeschichtsschreibung insbesondere in Italien, Frankreich, England und den USA auseinanderzusetzen und entsprechende Kontakte auf ihren künftigen Versammlungen zu verstärken.
5. Die DGGTB muß die historische und theoretische Diskussion in den Biowissenschaften zu bündeln versuchen und aktuelle methodische Fragestellungen (z.B. Theorie der Selbstorganisation, "social constructivism", historische Anthropologie) und Problemkomplexe (z.B. Entwicklung der Evolutionsbiologie, Organismuskonzepte, Gentechnologie) aufgreifen.